Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Dgkd-201ENSMUST00000027517 5695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PolP10400 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PolP10400 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms