Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ophn1-202ENSMUST00000113826 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm15398-202ENSMUST00000219998 1477 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms