Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbdsP70122 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms