Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Defa6P50704 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Dclre1b-201ENSMUST00000029435 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Grm3-201ENSMUST00000004076 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Six6-201ENSMUST00000021519 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms