Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms