Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Kng2-201ENSMUST00000039338 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nop56Q9D6Z1 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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