Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms