Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Srsf7-201ENSMUST00000063417 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm27395-201ENSMUST00000183938 460 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm38941-201ENSMUST00000208606 529 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Rarres2-201ENSMUST00000009425 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Olfr17-201ENSMUST00000098138 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm18500-201ENSMUST00000223493 820 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 4933436P19Rik-201ENSMUST00000217736 1442 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 AC160550.2-202ENSMUST00000227812 1861 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Olfr960-203ENSMUST00000216584 1148 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Olfr132-201ENSMUST00000087128 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Sell-202ENSMUST00000097491 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm38095-201ENSMUST00000192896 1402 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Mcm5-201ENSMUST00000164309 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Ntpcr-208ENSMUST00000152189 822 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm26834-201ENSMUST00000181815 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Shisa5-204ENSMUST00000196954 843 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm42871-201ENSMUST00000199333 315 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Lyrm7-205ENSMUST00000144164 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Crp-201ENSMUST00000038495 1695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm11224-201ENSMUST00000120465 1111 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm28167-201ENSMUST00000187644 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm29572-201ENSMUST00000190305 283 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm8388-201ENSMUST00000193000 756 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 AC068459.1-201ENSMUST00000222492 905 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gzma-202ENSMUST00000224282 996 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms