Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Meis2-201ENSMUST00000028639 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Slc7a9-202ENSMUST00000118383 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Atp9a-202ENSMUST00000109175 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ccpg1-202ENSMUST00000085350 2969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GscQ02591 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Eif4e2-201ENSMUST00000050876 2869 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms