Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Smarcc1P97496 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Smarcc1P97496 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smarcc1P97496 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smarcc1P97496 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smarcc1P97496 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smarcc1P97496 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smarcc1P97496 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms