Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snap25P60879 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snap25P60879 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms