Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm21634-201ENSMUST00000190775 694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21506-201ENSMUST00000190786 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21201-201ENSMUST00000190814 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20848-201ENSMUST00000190836 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20860-201ENSMUST00000190842 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21838-201ENSMUST00000190955 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm29267-201ENSMUST00000191020 378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20882-201ENSMUST00000191028 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20798-201ENSMUST00000191050 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28107-201ENSMUST00000191118 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21875-201ENSMUST00000191195 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21285-201ENSMUST00000191214 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21908-201ENSMUST00000191224 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21924-201ENSMUST00000191308 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28459-201ENSMUST00000191319 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21316-201ENSMUST00000191348 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20893-201ENSMUST00000191376 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21287-201ENSMUST00000191377 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21790-201ENSMUST00000191392 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20808-201ENSMUST00000191433 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21114-201ENSMUST00000191466 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21872-201ENSMUST00000191488 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21755-201ENSMUST00000191507 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21151-201ENSMUST00000191536 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20862-201ENSMUST00000191559 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20891-201ENSMUST00000191560 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21774-201ENSMUST00000191592 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21076-201ENSMUST00000191597 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21672-201ENSMUST00000191609 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21791-201ENSMUST00000191631 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm31186-201ENSMUST00000191786 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21065-201ENSMUST00000191793 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21845-201ENSMUST00000191848 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20840-201ENSMUST00000192165 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21469-201ENSMUST00000193164 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21427-201ENSMUST00000193270 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm35955-201ENSMUST00000193437 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm31335-201ENSMUST00000193949 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20925-201ENSMUST00000193967 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21661-201ENSMUST00000194101 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21412-201ENSMUST00000194618 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm38016-201ENSMUST00000194806 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21763-201ENSMUST00000195140 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21890-201ENSMUST00000195190 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21350-201ENSMUST00000195678 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm44978-201ENSMUST00000206635 317 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm18471-201ENSMUST00000208272 452 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tcl1-201ENSMUST00000041316 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Rpl14-ps1-201ENSMUST00000026901 653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Als2cr12-201ENSMUST00000055313 1540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Gm13472-201ENSMUST00000120948 314 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm40604-201ENSMUST00000217765 655 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm18670-201ENSMUST00000218712 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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