Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Lyrm7os-201ENSMUST00000154044 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm15455-201ENSMUST00000117459 2557 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Six6-201ENSMUST00000021519 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC154377.1-201ENSMUST00000226752 4979 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Kif28-201ENSMUST00000131716 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm17249-201ENSMUST00000181277 3500 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Dcx-202ENSMUST00000087313 3120 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ovch2-201ENSMUST00000106755 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Apol7b-201ENSMUST00000089469 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Retsat-201ENSMUST00000070597 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Fam110b-202ENSMUST00000108380 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ccdc148-201ENSMUST00000077687 3977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ect2l-203ENSMUST00000207827 2730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms