Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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