Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Zfp672-203ENSMUST00000065533 2619 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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