Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh13Q8CEE7 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms