Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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