Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Zfp469-202ENSMUST00000187142 3082 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Osbpl9-218ENSMUST00000162787 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Mfap3l-201ENSMUST00000034066 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Atg14-201ENSMUST00000042988 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Osbpl3-201ENSMUST00000071728 3307 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm20743-202ENSMUST00000194322 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Vps8-205ENSMUST00000118138 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Mis18bp1-201ENSMUST00000052201 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Ldb2-205ENSMUST00000199261 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2iP60898 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC9.59□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Gm43318-201ENSMUST00000199939 1949 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2iP60898 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms