Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm20856-201ENSMUST00000186896 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21127-201ENSMUST00000186909 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28371-201ENSMUST00000186936 695 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20884-201ENSMUST00000186946 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28657-201ENSMUST00000186950 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20930-201ENSMUST00000186998 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20933-201ENSMUST00000187070 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21476-201ENSMUST00000187167 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20886-201ENSMUST00000187173 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20803-201ENSMUST00000187186 694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21753-201ENSMUST00000187240 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21864-201ENSMUST00000187269 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20880-201ENSMUST00000187276 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28603-201ENSMUST00000187297 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20791-201ENSMUST00000187310 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28770-201ENSMUST00000187354 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21249-201ENSMUST00000187380 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21180-201ENSMUST00000187388 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21819-201ENSMUST00000187438 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20842-201ENSMUST00000187463 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21333-201ENSMUST00000187487 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21435-201ENSMUST00000187508 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20935-201ENSMUST00000187518 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21879-201ENSMUST00000187583 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20801-201ENSMUST00000187654 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21111-201ENSMUST00000187671 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20859-201ENSMUST00000187743 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21248-201ENSMUST00000187765 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21642-201ENSMUST00000187826 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20747-202ENSMUST00000187856 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20866-201ENSMUST00000187981 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21340-201ENSMUST00000188010 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21751-201ENSMUST00000188043 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20864-201ENSMUST00000188075 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20810-201ENSMUST00000188122 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm29317-201ENSMUST00000188216 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21724-201ENSMUST00000188264 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm29002-201ENSMUST00000188301 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28144-201ENSMUST00000188351 699 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20804-201ENSMUST00000188372 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21396-201ENSMUST00000188391 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21806-201ENSMUST00000188405 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21792-201ENSMUST00000188516 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21782-201ENSMUST00000188517 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21881-201ENSMUST00000188591 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20887-201ENSMUST00000188597 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21771-201ENSMUST00000188693 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20846-201ENSMUST00000188700 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Gm21302-201ENSMUST00000188765 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20863-201ENSMUST00000188992 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28093-201ENSMUST00000189016 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20849-201ENSMUST00000189065 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm28915-201ENSMUST00000189145 699 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20912-201ENSMUST00000189184 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20913-201ENSMUST00000189188 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm29333-201ENSMUST00000189258 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21163-201ENSMUST00000189276 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21779-201ENSMUST00000189508 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21745-201ENSMUST00000189513 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20853-201ENSMUST00000189591 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20895-201ENSMUST00000189601 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21380-201ENSMUST00000189621 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm29024-201ENSMUST00000189624 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Gm21281-201ENSMUST00000189900 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Gm21869-201ENSMUST00000189976 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21787-201ENSMUST00000189993 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21658-201ENSMUST00000190025 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cux1P53564 Gm20841-201ENSMUST00000190209 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21918-201ENSMUST00000190310 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm29279-201ENSMUST00000190324 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20934-201ENSMUST00000190359 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21868-202ENSMUST00000190370 694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21805-201ENSMUST00000190371 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20818-201ENSMUST00000190372 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21740-201ENSMUST00000190382 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21155-201ENSMUST00000190460 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21245-201ENSMUST00000190467 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21242-201ENSMUST00000190489 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21530-201ENSMUST00000190506 694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20904-201ENSMUST00000190518 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21802-201ENSMUST00000190593 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21799-201ENSMUST00000190662 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21835-201ENSMUST00000190671 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm21851-201ENSMUST00000190752 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cux1P53564 Gm20892-201ENSMUST00000190755 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms