Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm10741-201ENSMUST00000218151 1748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Nt5c1b-211ENSMUST00000218339 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Nt5c1b-201ENSMUST00000002456 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm22282-201ENSMUST00000158524 312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Olfr126-201ENSMUST00000174139 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm30173-201ENSMUST00000195035 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Ngf-204ENSMUST00000198644 1120 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Endov-201ENSMUST00000064513 954 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm4795-201ENSMUST00000095717 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Celf2-213ENSMUST00000150624 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Olfr1283-203ENSMUST00000216637 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Ccr6-206ENSMUST00000180103 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm6351-203ENSMUST00000139828 1542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Ces5a-201ENSMUST00000077816 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 9530056K15Rik-201ENSMUST00000061947 2315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm3126-201ENSMUST00000216513 1468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gngt2-206ENSMUST00000107712 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Asgr1-203ENSMUST00000108585 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm7761-201ENSMUST00000190510 921 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Chd1P40201 Gm45014-201ENSMUST00000207657 405 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 AC121997.1-201ENSMUST00000226423 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm5624-204ENSMUST00000227882 842 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 1700012A03Rik-201ENSMUST00000031778 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Smim7-201ENSMUST00000058733 642 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm16291-201ENSMUST00000147378 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Olfr452-202ENSMUST00000214465 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Ucn3-201ENSMUST00000058610 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Chd1P40201 Gm8957-201ENSMUST00000182082 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm18942-201ENSMUST00000213578 1121 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm24145-201ENSMUST00000082631 163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Tigit-201ENSMUST00000096065 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 G6pc-201ENSMUST00000019469 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Stmn1-202ENSMUST00000105867 802 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gstm5-204ENSMUST00000169365 810 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm20611-201ENSMUST00000177492 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm26834-201ENSMUST00000181815 950 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm43957-201ENSMUST00000203606 362 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Mkl2-202ENSMUST00000056715 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Nps-201ENSMUST00000097983 840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms