Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm3550W4VSN7 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms