Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 1700063D05Rik-204ENSMUST00000213914 1007 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Epb42P49222 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Epb42P49222 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms