Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CitP49025 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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CitP49025 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CitP49025 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CitP49025 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CitP49025 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CitP49025 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CitP49025 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CitP49025 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CitP49025 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms