Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Mirg-204ENSMUST00000182185 3822 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf217D3YYI7 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms