Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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SrfQ9JM73 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr452-201ENSMUST00000075468 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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