Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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