Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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