Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms