Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh13Q8CEE7 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh13Q8CEE7 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh13Q8CEE7 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh13Q8CEE7 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh13Q8CEE7 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh13Q8CEE7 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh13Q8CEE7 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh13Q8CEE7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh13Q8CEE7 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh13Q8CEE7 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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