Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm6225-201ENSMUST00000181558 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Nectin3-205ENSMUST00000121245 953 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Elof1-201ENSMUST00000013966 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Tmem89-202ENSMUST00000192852 945 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Etv3l-201ENSMUST00000193196 325 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm44978-201ENSMUST00000206635 317 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 AC161763.1-201ENSMUST00000227063 168 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Mif-201ENSMUST00000038169 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm6457-201ENSMUST00000066378 815 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Rad52-212ENSMUST00000162461 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 4933436P19Rik-201ENSMUST00000217736 1442 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp54Q8BL06 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm45521-201ENSMUST00000211339 676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Olfr1491-204ENSMUST00000216366 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gtf2f2-201ENSMUST00000088922 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm13397-201ENSMUST00000119562 878 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm12738-201ENSMUST00000122349 536 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm8425-201ENSMUST00000171395 769 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Cd209b-203ENSMUST00000171635 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm21818-201ENSMUST00000178828 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms