Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms