Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Usp30Q3UN04 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Usp30Q3UN04 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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