Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GscQ02591 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Lhx6-204ENSMUST00000112966 3188 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Mef2a-208ENSMUST00000156690 5538 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GscQ02591 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms