Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcntP48725 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcntP48725 E330017L17Rik-202ENSMUST00000139190 861 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Gm15645-202ENSMUST00000183393 1299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Gm8982-201ENSMUST00000184198 1295 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcntP48725 Gm10113-201ENSMUST00000072437 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 D330041H03Rik-207ENSMUST00000181760 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcntP48725 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcntP48725 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcntP48725 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcntP48725 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PcntP48725 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PcntP48725 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PcntP48725 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PcntP48725 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms