Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms