Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms