Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Sidt2-202ENSMUST00000114573 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chmp2aQ9DB34 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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