Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms