Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCS6

Pabpn1, Polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1Q8CCS6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpn1Q8CCS6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpn1Q8CCS6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpn1Q8CCS6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpn1Q8CCS6 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm15520-201ENSMUST00000132097 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm13402-201ENSMUST00000153600 424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Zfp978-202ENSMUST00000154154 1250 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm15749-201ENSMUST00000161848 612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 H2-M5-203ENSMUST00000169189 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm18500-201ENSMUST00000223493 820 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Olfr237-ps1-201ENSMUST00000095953 1000 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm13655-201ENSMUST00000119695 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm15086-201ENSMUST00000143110 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm8813-201ENSMUST00000155930 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Ear6-202ENSMUST00000169070 893 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm17169-201ENSMUST00000171382 351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm25736-201ENSMUST00000175165 101 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm15100-201ENSMUST00000180357 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm44331-201ENSMUST00000203217 388 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Pfdn4-202ENSMUST00000075087 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm5975-201ENSMUST00000185256 1399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Glod4-209ENSMUST00000170710 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Ucn3-201ENSMUST00000058610 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm26953-205ENSMUST00000212599 1435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm8818-201ENSMUST00000110797 1047 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Magea7-ps-201ENSMUST00000117727 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pabpn1Q8CCS6 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm23786-202ENSMUST00000200181 119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Apom-201ENSMUST00000025249 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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