Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm44570-201ENSMUST00000207526 3698 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp19Q3UJD6 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp19Q3UJD6 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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