Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Otud5Q3U2S4 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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