Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SbdsP70122 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SbdsP70122 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms