Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm2035J3QP87 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm37893-201ENSMUST00000192826 2437 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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