Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

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Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vav3Q9R0C8 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vav3Q9R0C8 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vav3Q9R0C8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vav3Q9R0C8 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vav3Q9R0C8 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vav3Q9R0C8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vav3Q9R0C8 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav3Q9R0C8 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Vav3Q9R0C8 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav3Q9R0C8 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms