Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trak1Q6PD31 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trak1Q6PD31 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms