Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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