Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm8425-201ENSMUST00000171395 769 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Pon1-203ENSMUST00000176945 619 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm29388-201ENSMUST00000190718 284 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm6073-201ENSMUST00000198253 466 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm11401-201ENSMUST00000117212 344 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm13623-201ENSMUST00000118359 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Cd209b-203ENSMUST00000171635 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm9825-201ENSMUST00000178598 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm18670-201ENSMUST00000218712 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 6330415B21Rik-201ENSMUST00000204215 2200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tes-201ENSMUST00000076654 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Mrgpra2b-201ENSMUST00000119798 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Rpl19-ps11-201ENSMUST00000122422 591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Rspo4os-201ENSMUST00000152229 1281 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Ccdc190-202ENSMUST00000175731 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm17806-201ENSMUST00000195844 383 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm45538-201ENSMUST00000210771 1061 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Olfr1491-204ENSMUST00000216366 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Rpsa-ps11-201ENSMUST00000118446 889 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm13397-201ENSMUST00000119562 878 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm5459-201ENSMUST00000171235 798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Ucma-205ENSMUST00000195688 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm29961-202ENSMUST00000215431 637 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 AC118704.1-201ENSMUST00000225022 695 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 1700029F12Rik-201ENSMUST00000091377 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gzmb-201ENSMUST00000015581 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm19001-201ENSMUST00000222736 1651 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms