Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Pde1bQ01065 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pde1bQ01065 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pde1bQ01065 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pde1bQ01065 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pde1bQ01065 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pde1bQ01065 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pde1bQ01065 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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