Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm45780-201ENSMUST00000212089 224 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm3617-201ENSMUST00000173076 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Cnfn-201ENSMUST00000076276 524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tead4-203ENSMUST00000130454 1718 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Pcsk2os1-202ENSMUST00000156780 527 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 1700013G24Rik-201ENSMUST00000048893 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cux1P53564 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 363.2 ms