Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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